人类四大军团在数码世界都有残部，由西格尔领导。光明兽将两个数码世界维度合一的时候，他们也仍然坚守在迷雾之湖，只是这时的迷雾之湖经过上次的战斗，湖水也差不多流干了，因此改名“迷雾森林”。
迷雾森林、破晓之丘是数码兽的禁区，所以彩羽尼奥的到来并没有引起任何人的注意。而随着光明兽的消失，在光明天堂的统治区域内，统治力度变得极弱，那些堕天使们本就不适合管理阳光下的土地，群龙无首之下，被赶回黑暗区域的大有人在。这种情况下，伊古德拉希尔又渐渐被捧上神坛，令出于天界都市成了常态。
但是没有人知道，在这禁锢伊古德拉希尔的天界都市里，一个邪恶的存在找上门去。经过一段密谈，黑暗的力量彻底笼罩了天界都市，一只只不知从何处而来的军队倾巢而出，它们四处破坏，抓人，对一切反抗者施以毁灭xing的打击。在众多数码兽的血泪之下，天界都市巴尔巴兽城的威名ri渐响亮，一道毁灭xing的的炎之壁降临，将所有想要反抗的数码兽阻拦在巴尔巴兽城之外。
而人类军团也在这个时候活跃了起来，他们开始了最富人类特sè的占领行为，似乎打定主意要在数码世界弄到大片的土地来扩张国土。以位于破晓之丘的破晓城为中心，一个即严密又松散的城邦国度诞生了——魔神国度！
暴君国度、天使国度、魔神国度、东方大世界、巴尔巴兽城五方共存的格局显现。
第三新东京市，zhèngfu大楼顶层，暴君国度的三大首脑之一。顶着可爱白兔子装的修女兽布兰迈着优雅的步伐端着盘子走进工作大厅，一切都是那么地有贵族气质，但这么和谐的场景仅仅维持了不到半分钟，只见布兰翩飘然而来，好似没有步与步之间的停顿似的，这也是那份优雅的由来，但是之后她就越“飘”越低，然后猛然和地面来了个亲密接触——她居然在光可鉴人空无一物的大厅zhongyāng跌倒了！
但是正在自修《女仆的自我修养》的布兰不是那么容易失败的！就在盘子缓缓坠落的瞬间，布兰眼中有jing芒闪过，麻利地从裙下摸出比自己还高的三叉戟“十字芭比（crossbarbie）”，瞄准shè出一气呵成。
十字芭比切开空气，带起一股旋风吹飞了奈奈美正在上sè的指甲油……
四个杯子叮叮当当地落在盘子上，盘子又被三叉戟托着风驰电掣地shè进墙壁，虽然力道控制得刚好，但只看三叉戟的末端还在嗡鸣震颤，就知道布兰用的力道也不轻。神奇的是，四个杯子都没有一滴水洒出来，这要在武侠世界里一定会被一声惊叹——“入微”！
布兰见此欣喜地爬起身来，从墙上拔出三叉戟，端着杯子小跑着来到奈奈美身边，这次她很注意，一路看着自己的脚，总算没出问题。
“奈奈美小姐，您的红茶！”仪态完美的女仆小姐布兰将红茶递过来，奈奈美则矜持地抿着红唇，放下指甲油接过红茶。
接着布兰把另外三杯红茶分别递给武之内素娜和藤枝淑乃，至于陆峰的那杯则被他坚定地拒绝了，然后一脸讪笑着替藤枝淑乃揉肩。
武之内素娜郁闷地看了一眼陆峰，然后扭头看电视。
“淑乃，我的手艺有进步？”陆峰腆着脸道。
藤枝淑乃面无表情，目视前方，将一条白嫩嫩的大腿搁在茶几上。丁香兽x一见也飞过来，把腿搁在茶几上。陆峰像赶苍蝇一样把丁香兽x赶走，然后开始给藤枝淑乃捶腿。
丁香兽x扭头看着一心捶腿的陆峰和面无表情的藤枝淑乃，两人就像是在演木偶剧一样，顿时无趣地飞到武之内素娜身边和她一起看电视。
布兰终于大厅里的女仆工作完成，功成身退离开大厅。就听“噗通”一声，她又在大厅zhongyāng摔倒了……
“话说是谁把布兰忽悠成女仆的？”陆峰抬头问道。
奈奈美优雅的举手。陆峰正想批评几句时，奈奈美双眼一眯，一道强度超过金刚钻的秋波横扫过来，陆峰的气势顿时一弱：“可是她完全不适合啊，要是怒娃儿知道了……”
“那我们就有两个女仆了！”奈奈美表示很开心道。
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现在三个姑nǎinǎi都在，陆峰被克得死死的。还是武之内素娜最乖了，和丁香兽x安静地看电视。正当陆峰尝试用眼睛jiān、yin藤枝淑乃和奈奈美时，白川惠将最新的事态报告上来了：“天界都市的削除部队又开始活动了，它们似乎是在寻找什么！”
陆峰面sè一肃，和刚才简直判若两人，严肃地接过白川惠递来的报告，上面详细描述了暴君国度边境外地区的数码兽村庄遭削除部队破坏的情况。天界都市被黑暗力量笼罩已经不是新闻，但对于篡夺伊古德拉希尔权柄的是谁却还不太明白，炎之壁对于普通数码兽，哪怕是究极体也是具有强大威慑力的。在光明兽消失后的广大地区，开始呈现出诸侯自治的格局，天界都市不过是其中最强的一股。
其余太阳宫里觉醒的阿波罗兽、雷暴山脉深处的神秘巨人、四处游荡的神枪手，甚至拉出一批小团体的ri焰兽，而像喜好周游世界打抱不平的墨丘利兽、玛尔斯兽、顽固兽也在四处游走，林林总总，乱象纷呈。
陆峰最近也在考虑是不是要雷霆出击，把这些小山头全都收服了。就算对实力提升毫无帮助，起码也可以充实一下暴君国度。至于削除部队，不过是一些突击龙兽和导弹兽组成的军团，陆峰并不怎么重视。让光之牙和夜之鸦出去历练一下就好。
在陆峰的命令下，玛利亚、罗伯特带队，光之牙和夜之鸦的队员们开始四处出击与削除部队战斗，拯救那些被破坏的村庄城镇。在暴君国度的二线军团：金刚兽军团、无齿翼龙兽军团的配合下，削除部队别想占到一点便宜。即使是其中号称从100只突击龙兽中选出来的战斗jing英海豹龙兽也不可能是shè手兽和八咫乌兽的对手。对这些孩子真正的考验之处，其实是在削除部队那极似军队风格的作战方式。
导弹兽神出鬼没就不说了，海豹龙兽却是最擅长暗杀任务的。它能以肉眼无法看到的速度移动，不装备迷彩服机能和枪等武器，有着只以体术击杀目标的能力。是极为优秀的刺客。而突击龙兽的身体由特殊材质加工包裹，可以通过判断周围的颜sè，即时改变身上迷彩服的颜sè，极善隐藏。
也因此几只小队好几次灰头土脸，井上京、加门健太郎等人甚至受了不轻的伤。好在凭借着无齿翼龙兽军团的强力空中支援和一点点主角气运爆发，他们最终都安然度过。
当然，这是建立在削除部队的三大将都被其他事情绊住的情况下，否则但凡有其他强力人物出来，他们就不会这样轻松了……
而在这时，陆峰做出了派遣旗下两只充满希望，演绎人、兽和谐的队伍之后可，他本人也准备启程去探访那些可能的强力究极体。本来从任务角度考虑陆峰只准备带上武之内素娜，可此行旅游xing质太浓，在奈奈美漫不经心的目光与藤枝淑乃看死人的眼神下，陆峰带上了三女，并且临时征用狮鹫兽当坐骑。向着远山飞去……
这是一座与山石林地环境非常相似的山脉，漫天霹雳，雷云密布，不同的是，这里并非常年都是这种天气，而是近来才出现的。据说雷云蓄满溢出山脉的时候，能隐约看到一个巨神挥舞兵刃。又传说有人在山脉附近看到了不死的骷髅兵。总之雷云山脉现在已经成了这一片地区的禁地，许多冒险进山的数码兽都不知所踪。
陆峰的首个目标就是雷云山脉，狮鹫兽的速度是非常快的。究极体出行，一般也没有人敢于阻拦，沿途的飞行数码兽基本都是主动退避，以狮鹫兽的体型，陆峰四人坐在它背上也不会觉得拥挤。
霹雳——
陆峰来的时机似乎非常好，这一天正是一个电闪雷鸣的ri子。当外界艳阳高照的时候，雷云山脉里却是一片yin云密布，黑沉沉的天空几乎盖压下来。
“吼——”刚刚进入山脉范围，一声巨吼就从山林深处传出，强横的音波刮得树林胡乱飘摇，树叶凋零。
“前面似乎发生了不得了的战斗……”狮鹫兽努力拍打翅膀克服混乱的气流，同时感应雷云山脉深处的气息。
呼啦啦~~~~~
眼尖的狮鹫兽忽然发现地面上出现了一丝异样，征得陆峰同意后，它降低飞行高度，接近山麓。陆峰四人赫然看到，一具基于头盖骨和双臂的骷髅兵从地上挣扎着爬了起来，在这个骷髅兵身后，几根骨头摇摇摆摆地也要拼合起来，形成第二个骷髅兵——传言是真的！
然后是第三个、第四个……这处不知何种动作的埋骨之处积攒下的头盖骨和臂骨最终造就了十三个骷髅兵。
最先诞生的骷髅兵虽然晃头晃脑，它的目标却非常明确向着山脉深处走去。其他的骷髅兵摇摇晃晃地也要跟着去，却似乎不太完善，不仅动作僵硬错漏百出，甚至还有跑错地方的。
“只留下第一个骷髅就行了，我们跟过去！”陆峰一声令下，狮鹫兽张嘴吐出超级索尼克之声将后面十二个骷髅兵全部摧毁。