李由基虽然才智过人，但他真正擅长的并不是军械的制作，一般而言军械要求声势夺人，李由基擅长制作的是杀人无声的暗器。李由基的特殊才能很快被发掘出来，他被调离了军队，调到了帝国的特务机构里专门研究暗器制作。
李由基在新的岗位上认识了那个女人。
那个女人，搅乱了天下，用经典的美人计手段，并且认为自己有搅乱天下的理由，也是经典的痛恨天下的理由，因为天下从来没有善待过她。
那个女人，原本生活在一个平静的小村庄里，或许还有一个算得上幸福的童年，这个平静的小村庄，以及她可能还算幸福的童年，一夕之间全被毁了。
那个平静的村庄出现了疫情，其实并不严重，只是小疫情，根本不会死几个人。但是这个疫情，层层上报上去之后，就成了异常严重的疫情，严重到可能会毁灭整个帝国。出现这种错误的原因有很多，有庸医的误诊，有粗心大意吏员的笔误，有心怀鬼胎官员的夸大其词等等等等，这些错误汇聚在一起，终于让这个小疫情被帝国的中心的那些掌权者们误认为是天大的疫情。
疫情刚出现的时候，村里的几个人出现了上吐下泻的症状，当时还没人想到可能是疫情，只当是这些人吃坏了肚子，村里人都是吃的泉水，也很少想着烧开再喝，出现些吃坏肚子的人也是平常。村里人请来了大夫，这个大夫是一个没什么本事，只能混迹在乡间的普通大夫。虽只是普通大夫，但因生性谨慎，又只看些简单疾病，也从未犯过什么错，在乡间也是颇受好评。
跟着普通大夫来的，还有一个回来看望普通大夫的年轻大夫。年轻大夫早年跟着普通大夫学医，是一个有些天赋的人，但自认为自己有的天赋却要远远超过自己实际有的天赋。年轻大夫有了这样的心气，自然是跟着普通大夫学了几年，就认为再跟着他学下去就是浪费自己的天赋，于是辞别了普通大夫，到城里找名医拜师去了。年轻大夫在外学了几年，这次回家之时顺便看望普通大夫，纯粹是因为他现在拜师那位名医一直强调做人要尊师重道，知道感恩。年轻大夫担心自己若是从不看望普通大夫，会被人传出不尊师的流言，不利于他今后在名医那里发展。年轻大夫其实不仅是看不起普通大夫，甚至会暗恨普通大夫耽误了他好几年，降低了自己出身档次。
普通大夫看过这些病人，认为只是小事，吃些药就好。普通大夫虽然有关于疫情的观念，但并不知道教材中是如何定义疫情，根据他的经验，现在的情况只是一些人得了小病，可能会把这些小病传染给其他人，无论如何，都不是什么大事。年轻大夫已经背过教材中关于疫情的定义，知道现在这种情况符合疫情的定义。年轻大夫虽然也清楚并不是严重的疫情，但想到根据帝国律法的规定，所有的疫情都应按规定的程序处理，普通大夫现在这种做法是违反规定的，年轻大夫就决定适当夸张这里的疫情，并且向上举报普通大夫。
年轻大夫当时就当着病人的面说这是疫情，很严重。普通大夫说这不是什么大事。年轻大夫与普通大夫争执一番，就拂袖离去。那些病人看到争执，心中不免有些担心。普通大夫劝他们心宽。
年轻大夫向地方官府举报了普通大夫隐瞒疫情，地方官府派出了第一个大夫。第一个大夫是一个有真本事的大夫，除了担任官府的职责之外，还自己开有医馆，口碑不错。第一个大夫到了村子里，看了病人，虽然也认为现在的情况符合疫情的定义，但同时也认定只是小事情，不应大惊小怪，普通大夫开的药也算是对症，同时自己也开了一些有利康复的药。第一个大夫回去之后就汇报说，虽是疫情，但只是小疫情，已经用过药，不会有问题，普通大夫处理虽不符合规定，但也不算大过。
官府听了第一个大夫的汇报，决定不再追究。
事情本该到此结束，但又起了波澜。当第一个大夫说这虽是疫情，但同时也是小事情的时候，村子里的一个病人也听见了。这个病人是一个生性多疑的人，他虽然听到了第一个大夫的全部的话语，但他在意的只有这是疫情的话，虽然也没有忘记关于这并不严重的话，但他总是觉得大夫说不严重，是说错了，又或者只是在安慰人。
这个多疑的病人，不仅是在心里多疑，还把自己的疑问说出来。别的病人都说他是在妄想，应该相信普通大夫。别人的劝说，并未让多疑的病人宽心，反而让他内心感到孤单，认为自己不仅正确，而且不能被世人接纳。生性多疑的病人，本就身体不好，加上这次的病情，加上严重的心病，生性多疑的病人一命呜呼。
生性多疑的病人这一死，也算是激起了千层浪。那些原本不信他的人，也开始怀疑他说的可能是真的。一时间，人心惶惶。一直关注这件事情的年轻大夫看到了机会，他向官府报告，疫情可能家中了，已经开始死人了。
官府又派出了第二个大夫。第二个大夫其实是一个庸医，却很有名望。这是因为第二个大夫从来只是纸上谈兵，他在官府任职多年，写过许多医学文章，获过许多奖项，却从来都没治疗过一个病人。第二个大夫从官府里领了任务，到村庄里走了一圈，就认定这里发生了严重的疫情。
虽然第一个大夫反对第二个大夫的判断，但他在地方官员面前根本说不过擅长夸夸其谈的第二个大夫。
地方官员见第二个大夫在辩论中气势更胜，又想到第二个大夫荣誉等身，就信了第二个大夫所说，认为村庄里发生了严重的疫情。