跨海突袭舰队出航之后，商毅也回到杭州，开始布置江北、江南一带的战斗。
这时商毅己经收到了湖北战区收复蕲水县的消息。而对第六军准备首先攻打黄州的决定，商毅也并没有任何异议。其实一般在绝大多数的情况，商毅都不会轻易干涉前线指挥人员的意见，因为商毅清楚，后方干涉前线的指挥战术，是兵家大忌。再有才能的名将，只要不是亲自在第一线指挥，那么对战场情况的俱体了解，就肯定比不前线的指挥人员，因此与其胡乱指挥，不如充份相信前线指挥人员的能力。而且以自己现在的身份，过多的干涉，也会影响他们在部队里的威信。
而另一方面，从全局来看，收复南京的战役己经启动了，湖北战区也是其中重要的一环，主要的责任是吸引清军的兵力，分散南京战争的压力。这也是商毅当初开避湖北战场的初衷，而从现在收到的消息来看，清军也确实准备集中大量的兵力，向湖北战区再度发动进攻，因此从这个角度来看，第六军进攻黄州，无论能不能成功，都将迫清军启动进攻湖北的军事行动。这样一来，在江南战场，浙江方面也将正式对南京发动进攻。
因此商毅立刻回复李定国、李岩等人，表彰了攻取蕲水县的胜利，同时也要求他们在进攻黄州的同时，也要做好充份的准备，迎战清军的大军。
收到了商毅的回复之后，李定国也立刻下令起兵，进攻黄州。
这次进攻黄州，李定囯出动了两个师，一个旅的兵力，希望能够一举攻下黄州。但战斗的进程却有些出乎李定国的预料。
因为这时守在黄州的尚善也收到了洪承畴和多铎下达的死命令，必须守住黄州，否则所有将领全都斩首。这时在黄州城中的淸军约有二万七千左右，其中满汉旗军约有一万二千人，都是在第三次进攻湖北的败军，主要的将领有蓝拜、阿哈尼堪、马光辉、李思忠、刘良佐、刘泽清等人。拥有各种火炮近百门，其中红衣大炮有二十门，霹雳火炮三十门，另外还有四千多名火铳手。在第三次征剿湖北的战斗中,刘泽清犯下了大错,本来己被革职,但现在正是用人之际,因此尚善也让刘泽淸带罪立功。
尚善在城中向众将宣布，死守黄州，不许后退的命令。同时也抽调人手，组成了执法队，凡事敢临阵脫逃，守城不力者，一率斩首。黄州城的南面靠着长江，因此只用驻守东西北三面，而尚善也下令，将东西两面的城门堵死，只留南北两西的城门出入，同时又把南城外的船只全都驶到江南停泊，在江北不留一艘，这样也彻底断绝了守军的逃生之心。
而且趁着商家军修整扩编的这二十几天，清军也没有白白浪废，也抓紧了难得的时间,加强黄州的城防。在东西北三面的城墙，都建造了许多炮台，并且制造了大量守城的工具器械，还拆毀了数百间民房，而拆下来的木材、石料、瓦片等物，也全都用来守城。
同时尚善也做好了和商家军打巷战的充份准备，在黄州城內的街道也层层设防，俢筑了大量的防御工事，箭楼、堡垒等等，在城內也形成了两道防线，就算黄州的城墙被商家军攻破了，清军也同样可以依托城内的工事抵挡商家军的进攻。
最让人感觉到意外的是，尚善居然在最有可能受到商家军攻击的北门掘出了二道战壕，相隔约有十丈，并且也用泥土布袋在战壕边垒成矮墙，并且把火铳兵和一部份弓箭手放在第一道战壕里驻守，到是把商家军的这一战术学了个七八成。但不同的是，在第二道战壕里，派遣了一部清兵驻守，准备等商家军攻到战壕边之后，与商家军进行白刃战。而所有的火炮则全部都放在城墙。
虽然尚善和商家军交手过几次，也吃过这种战壕防守的大亏，但轮到自己使用战壕防守，心理也没有多少底，毕竟也只是依样画葫芦，而且清军的火枪比商家军也差了好几个档次，因此真正学会了几成，又能够发挥多少作用，连尚善自己都不清楚，反正现在也没有别的办法了，只看见商家军用这一套用得是很顺手的，只好是病急乱投医，不管什么招，也都先用一用再说。就算不好使，最后也就是再退回到黄州城里来防守。
李定国也沒有想到，清军居然也学着商家军，挖战壕防守，虽然只是在一面布置了战壕，但黄州的北城确实是最适合发动进攻的地方，因此只能从这里开始进攻，无论清军把这一招学得怎么样，但如果不首先攻破战壕，也就无法直接攻击黄州的城墙。
于是就在九月二曰，商家军开始黄州城发动进攻。
但战斗打响之后，李定国这才发现，以前一直是商家军克敌制的战术，被淸军学会之后，也同样给商家军造成了极大的麻烦。
商家军首先使用火炮轰击，希望利用射程的优势，直接攻击清军的城外防线，迫使清军退入黄州城里去防守。但李定国却没有想到，战壕防守战术，是后世经过了两百余年的经验之后，才总结出来的，其甴是在近代和现代战争早期最有效的防守战术之一。
无论淸军是不是理解了战壕防守战术的原理，但事实是，尽管商家军的火炮在射程占有绝对的优势，而且又是使用的杀伤力大开花弹，但由于使用战壕防守，使清兵的整个身体大部份都躲避在地平线以下，也使开花弹的杀伤力大大降低。除非是炮弹能够准确的落到战壕里，否则很难有多少作用。
在商家军猛轰击了一阵之后，尽管淸军没有任何的还手之力，但实际的作用并不大。当然如果釆用不计成本的火力覆盖打击，也不是完全沒有用。但尽管己经打通了水路的运输线，湖北战区的补充仍然很困难，因此在湖北战区是耗不起这样的用法。另外湖北战区的商家军一共也只有一个炮兵团，火炮的数量也有限，难以对清军形成密集的打击。
因此在轰击了一阵，发现想仅靠火炮就击跨清军的城外阵地，根本就是不可能的，李定国也果然下令，命一个步兵团在火炮的掩护下，向清军的阵地发动进攻。
而这时尚善、蓝拜、阿哈尼堪等人也都聚集到黄州城北面的城楼观战，因为过去清军进攻商家军的战壕防线时，基本都沒有什么好办法，除了用人垫之外，也就是用骑兵冲。因此他们也都想看一看，现在攻守异位，商家军有什么办法来攻破战壕防线。那么自己日后也可以学着使用。
在商家军的步兵靠近了清军的防线之后，尚善也立刻下令，城头布置的各种火炮也都一起开动，向进攻中的商家军士兵展开打击。
城头的火炮也轮番响起，各种实心弹、开花弹也都狠狠的砸向商家军，很快在商家军的进攻部队中，就开始产生伤亡，当然这也是进攻的一方必需付出的代值。
但很快尚善等人就发现，商家军的进攻方式，和清军有很大的不同，而最大的区别就在于商家军的战线拉得很开，士兵之间的距离很大，就算是目测，至少也在两丈以，大多数都在三四丈左右，而无论是清军，还是过去的明军，士兵之间的距离基本不会超过一丈远，因此这就使商家军虽然只是三千多人进攻，但看起来却仿佛是有万人的规模。
而阵形拉开了以后，在进攻的过程中，受到的打击也就要小得多，如果是在过去，一颗实心弹至少也能打中四五个人，但现在也就能击中一两个而已。就是开花弹，也顶多就是炸到三四个人。
其实以前商家军在进攻时也拉得很开，但淸军都沒有意识过这一点，只是在换了是使用商家军的防守战术，正所谓是以彼之盾，克彼之盾，因此这才都开始注意互相的区别，同时也都在认真思考商家军为什么会这样做。而事实是这样一来，损失确实减少了许多。
其实淸军的火炮数量也不算多，而且还要分守三面城墙，对商家军的打击也很有限，因此有许多商家军的士兵都冲到了离防线约五十步左右的距离。这也进入了清军的火铳的有效射程。淸军的火铳兵也以三段连射的方式，开始射击。
而在这时商家军的士兵大多数都会伏下身体，趴在地以肘膝用力，匍匐前行。而且这种前行的方式显然是经过严格训练过的，速度并不算慢。因为在五十步以内，基本是所有火炮的死角，在这个时候，只能靠战壕里的火铳兵来阻击商家军的继续进攻，而匍匐前行，能够极大的减少身体的受伤害面，同样也是另一种减少损失的好办法。
因此也看得尚善、蓝拜、阿哈尼堪等人惊叹不己，谁知道商家军会想出这种看似匪夷所思，但实际却是最合理，最有效的战术来呢？