这些“幽影水母”似乎将联盟舰队当成了入侵领地的敌人，瞬间发动了攻击。它们的触须释放出一道道黑色的电弧，击中战舰后，竟能直接穿透部分护盾，对舰体造成破坏。
联盟舰队即刻展开反击，光子炮、量子脉冲武器齐发，然而这些常规武器对幽影水母的伤害却十分有限。关键时刻，灵幻大陆的魔法师们联手施展了一种大型的元素封印魔法，试图困住这些水母生物。星语族的心灵感应战士们则努力与它们建立心灵沟通，尝试传达联盟并无恶意的信息。经过一番苦战与艰难的沟通，幽影水母们似乎理解了联盟的来意，停止了攻击，缓缓地散开，让出了一条道路。
联盟舰队继续前行，终于抵达了幽影深空的核心区域。这里有着一座巨大的、散发着神秘光芒的结构体，像是一座由古老文明遗留下来的巨型空间站，但它的构造和运行原理却远远超出了联盟现有的认知范畴。科学家们兴奋不已，迫不及待地派遣探测机器人靠近，想要揭开它的神秘面纱。
在对这座神秘结构体进行研究的过程中，联盟的科研团队遇到了重重困难。它的表面有着一层强大的能量防护层，常规的探测手段根本无法穿透。而且结构体内部似乎有着自己独特的空间法则，进入其中的机器人常常迷失方向，甚至莫名失联。经过无数次的尝试与失败，联盟的科学家们结合了幻光圣物研究中获得的关于能量操控的知识，以及星渊晶簇对时空扭曲的原理，终于找到了突破能量防护层的方法。
进入结构体内部后，联盟发现这里布满了错综复杂的通道和各种奇异的装置。有的装置像是巨大的能量核心，源源不断地释放出暗能量波动；有的则像是信息储存库，可惜联盟一时之间还无法解读其中的内容。在不断的探索中，他们意外触发了一个古老的防御机制，一时间，结构体内部涌出了大量的机械守卫。这些守卫外形犹如古代的战甲，手持能量武器，行动敏捷且配合默契，对联盟的科研人员构成了巨大的威胁。
联盟的护卫部队迅速投入战斗，与这些机械守卫展开了激烈的交锋。星际战士们利用灵活的战术和先进的武器装备，逐渐找到了机械守卫的行动规律，开始逐个击破。而科研人员则抓紧时间，在战斗的间隙尽可能多地收集数据、研究周边的装置。经过一番苦战，联盟成功压制住了机械守卫，并且获取了一部分关于结构体运行原理以及幽影深空维度奥秘的关键信息。
凭借着这些珍贵的资料，联盟的科学家们回到联盟总部后，展开了更进一步的深入研究。经过数年的努力，他们成功研发出了基于幽影深空维度技术的“跨维航行器”，这种航行器能够突破常规的宇宙空间维度限制，实现瞬间跨越遥远距离的星际旅行，极大地拓展了联盟的活动范围和战略优势。
在军事层面，联盟利用跨维航行器的优势，重新调整了宇宙舰队的部署和战略规划。舰队可以在瞬息之间出现在潜在敌对文明的边境，形成强大的军事威慑。同时，也能更快速地响应联盟各星区出现的紧急情况，保障联盟内部的安全稳定。
外交上，联盟凭借这一重大科技突破，吸引了更多宇宙文明的关注与合作意向。联盟举办了多场跨维航行技术交流大会，邀请各文明的科研代表前来学习探讨，秉持着共享共赢的理念，与众多文明达成了科技合作协议，进一步巩固了联盟在宇宙中的核心地位，促进了宇宙间不同文明的交流融合。
然而，随着联盟影响力的不断扩大，一些老牌的强大文明开始对联盟产生了忌惮之心。其中，“黑曜石帝国”是最为突出的一个。这个帝国掌控着广袤的星系领土，拥有强大的军事力量和高度发达的科技体系，长久以来一直以宇宙霸主自居。看到联盟的崛起，黑曜石帝国认为自身的地位受到了威胁，于是暗中联合了几个同样对联盟心怀不满的中等文明，组成了一个反联盟阵营。
反联盟阵营先是在宇宙贸易领域对联盟展开了一系列的限制措施，提高贸易关税、设置贸易壁垒，试图打压联盟各文明的经济发展。接着，在外交场合上，他们故意抹黑联盟的形象，散布各种谣言，声称联盟的扩张是一种侵略行为，企图破坏联盟与其他中立文明的友好关系。
联盟察觉到了这些不友好的举动，积极采取应对措施。一方面，联盟加大了对自身经济体系的扶持力度，鼓励各星区之间开展内部贸易，开发新的资源星球，降低对外部贸易的依赖。另一方面，联盟派出外交使团，积极与受到谣言影响的中立文明进行沟通交流，通过展示联盟的和平发展理念、合作共赢的实际成果，澄清那些不实的谣言。
但反联盟阵营并没有就此罢手，他们开始在边境地区频繁挑起小规模的军事摩擦。黑曜石帝国的精锐舰队时常越过边境线，对联盟的巡逻舰队进行挑衅，甚至发动袭击。联盟军队在保持克制的同时，也做好了充分的战斗准备。每次遭遇袭击，联盟舰队都会迅速做出反应，凭借着先进的装备和优秀的军事素养，给予对方有力的回击，让反联盟阵营的挑衅并未占到多少便宜。
为了避免局势进一步恶化，联盟决定主动与黑曜石帝国进行谈判。联盟的外交代表带着诚意和和平解决争端的方案，前往黑曜石帝国的首都星球。谈判桌上，双方你来我往，互不相让。黑曜石帝国要求联盟停止扩张，限制科技共享范围，而联盟则强调自身的和平发展理念，希望双方能够通过合作共同推动宇宙的繁荣发展，消除彼此的误解与猜忌。