随着朝廷进入了正常运作的阶段，朱载坖决定扩大在嘉靖朝已经实施的密疏制度，嘉靖朝的密疏主要是针对近臣尤其是阁臣的，但是现在朱载坖决定扩大密疏的范围，不仅是阁臣，朱载坖首先给蓟辽总督唐顺之和宣大总督曹邦辅以银章，准许密疏奏事。
结果朱载坖收到的第一份密疏就让朱载坖暴跳如雷，蓟辽总督唐顺之向朱载坖上密疏，陈述蓟镇的军粮问题，照例蓟镇的军粮是由京通仓支给的，但是近来蓟镇的军粮屡屡出事，奸商猾吏因缘为奸，米至腐烂不可食，唐顺之只得动用边储填补缺额，现在朝廷终于安稳下来了，唐顺之才以密疏上闻，请求朱载坖加以整顿。
朱载坖收到消息之后大怒，当即令厂卫派人先去蓟镇查实是否有此事，厂卫从蓟镇带回了一袋京通仓发运给蓟镇的军粮，除了沙子之外，全都是腐烂不能食用的大米和糟糠。
朱载坖将这袋米就放在文华殿，随后传旨召内阁辅臣、左都御史葛守礼、吏部尚书杨博、户部左侍郎总督仓场王国光、兵部尚书江东、刑部尚书黄光昇等人到文华殿来。
一众臣子们到了文华殿，见朱载坖在文华殿内放了一袋粮食，都有些不明所以，唯独户部左侍郎王国光有些不好的预感，按说虽然新任户部尚书马森还没有到任，但是积极专门把自己叫来，这袋粮食又是和户部的职守有关，王国光已经有一种不祥的预感了。
一众臣子们行礼之后，朱载坖说道：“诸位，这袋粮食是京通仓发运给蓟镇官军的，诸位可以看看，看看蓟镇官军平日里吃的是什么。”
一众重臣们都上前来查看这袋粮食，不看不知道，一看吓一跳，连一向波澜不惊的徐阶这次都难得的失态了，徐阶抓出一把粮食，对着王国光说道：“王司农，这就是京通仓给蓟镇的军粮？”
左都御史葛守礼更是怒发冲冠，当即指着王国光骂道：“王国光，你贪墨了多少？这是人吃的吗？”
杨博、江东两个知兵的臣子更是大惊失色，他们可是深知大明边军的德性，给他这种军粮，不哗变就是怪事了，这可不是在山西，这可是蓟镇，天子脚下，又是朱载坖刚刚登基，要是就搞出边军哗变的事情来。那朱载坖固然是没有脸面了，但是他们这些大臣们更是没有好果子吃。
杨博当即问道：“陛下，蓟镇军心如何？这种军粮，士卒要闹事的。”
朱载坖说道：“这种东西要是发下去了，拿不闹事才是怪的，唐顺之已经动用边储将这部分军粮替换了，现在就是要解决此事才行了。”
对于这事，朱载坖倒不认为是王国光所为，王国光没那么傻，这种事情一旦爆出，他作为总督仓场的户部侍郎是难辞其咎的，但是此事可以反映出来京通仓现在的情况恐怕不容乐观。
朱载坖问道：“王国光，京通仓现在存粮到底有多少？”
王国光说道：“按账册，存粮八百余万石。”
朱载坖说道：“朕不是问账面上的数字，而是问你实际有多少？”
面对朱载坖的追问，王国光说道：“实有多少，臣到任时间不长，尚未能一一掌握，不过据臣推断，不足五百万石。”
得知这个数字，别说朱载坖，就是徐阶都不能接受，徐阶厉声说道：“王国光，京通仓存粮不足五百万石，你为何不上报？你是不是从中也收取好处了？”
京通仓是关系到京师和九边安定的大事，也难怪徐阶会失态，京师官员士卒的口中所食，九边士卒的军粮，还有京畿应急赈灾，都要依靠京通仓的存粮，现在存粮不足五百万石，徐阶怎么能不激动，没有粮食，一旦出事是会要命的。
王国光无奈的说道：“下官嘉靖四十五年十二月才到任，京通仓中的情形还未了解清楚，不敢贸然上报，而且现在本就是仓中存粮最少得时候，漕粮未至而各边军粮已支，等到漕粮抵达，京通仓的存粮还是足够使用的。”
葛守礼拿着袋子中的粮食问道：“王国光，这就是京通仓支给蓟镇的军粮？王司农，这样的粮食，你吃的下去吗？”
面对葛守礼的质问，王国光无话可说，只得跪下请罪道：“臣死罪！”
杨博作为王国光的举主，也只得跪下请罪，但是张居正出来为王国光求情道：“陛下，臣以为此事王司农虽然有责任，但是仓场积弊久矣，小吏奸猾，王司农又刚刚上任，其中情弊，未可轻易归咎于王司农。请陛下明察。”
对于张居正的话，朱载坖觉得还是有些道理的，王国光就是有天大的胆子也不敢把这样的军粮发给蓟镇去，这其中的事情，就很难说了。
朱载坖说道：“看来这仓场的水很深嘛。”
朱载坖当即下令王国光罚俸、降级，戴罪立功以观后效，同时会同刑部、都察院、锦衣卫和东厂，详查此案，务必将此案的一干人犯全部缉拿，送交法办。
朱载坖问道：“都察院在仓场没有御史吗？”
葛守礼说道：“陛下，都察院在京通仓有巡仓御史，按定例，每季以监察御史、户部属官、锦衣卫千百户各一员往来巡察各仓门。京通二仓粟米凡系出纳，都要报知巡仓御史，与仓场衙门互相稽察，防止收迟浪费，改折侵冒。发现各总侵扣粮米，官吏人等勒索财物、科索运军、留难车户、乘贩济时获利，总督漕运官不监督所属部下，纵容他们沿途留滞作弊多端等等使仓政大坏之事，巡仓御史都要参奏究问，率官严捕治之。”
朱载坖听后冷笑道：“结果呢？仓场积弊至此，朕可见御史有弹章？将巡仓御史下诏狱严审，锦衣卫巡仓官下南镇抚司严审。”
朱载坖的态度很明确，既然账面上有八百万石，那你就得给朕找出八百万石粮食来。