朱载坖的意思已经很明确了，朕知道你们之前是被张居正收拾过的，现在张居正已经去位，你们也都得以起复了，朕可以处置王篆，给你们出出气，但是事情也就到此为止了，要是你们还不知趣，攀咬张居正的话，那朱载坖是绝对不会客气的。
朱载坖的态度已经是非常之明确了，朝臣也都明白了朱载坖的意思，王篆上疏辞谢之后，立即收拾包袱到南京上任去了，王篆的想法很简单，朱载坖只是将自己贬斥到南京去，朱载坖的意思也是很清楚的，先到南京去避避风头，等到风头过了，在怎么任用不就是朱载坖一道诏命的问题吗？
朱载坖通过这种方式试图达成朝廷的和解，朱载坖希望群臣们能够明白自己的意图，就将此事过去拉倒了，但是朱载坖显然低估了大明臣子们搞事情的能力，朱载坖的意思其实已经表达的非常之清楚了，但是这些人显然不肯罢休，还要继续咬住张居正不妨。
湖广道御史丁此吕上疏称：“礼部侍郎何雒文代嗣修、懋修撰殿试策，而侍郎高启愚主南京试，至以‘舜亦以命禹’为题，大不敬也。”
江西道御史李植上疏称工部尚书潘季驯朋党奸逆，诬上欺君，一时之间科道御史们揪住张居正儿子科举之事，弹劾张居正，同时将现任首辅张四维、次辅申时行等人也全部牵连进来，吏部尚书王国光、户部尚书梁梦龙、工部尚书潘季驯也全部受到弹劾，左都御史杨继盛被弹劾怯懦。
事涉科举弊案，不光是朝廷上下很关注，士林对此也是极为关注的，因为阁臣之子登科，本就是一件非常尴尬的事情，尤其是张居正的三个儿子加上张四维的儿子张泰征、张甲征，申时行的儿子申用懋都接连中进士，这当然是一件很操蛋的事情，不管他们是不是有真才实学，但是这件事情就是让士林非常之气愤了。
朱载坖对这些搅屎棍也是很头疼的，对于朱载坖来说，现在已经是岁尾年终了，朱载坖只想好好过年，结果这几个直接把整个朝廷给搞停摆了，这还得了，朱载坖一面下旨对于被弹劾的臣子们予以慰留，一面申斥这些臣子们，认为这些人是无事生非。
其实最头疼的就是申时行了，他自己的儿子申用懋刚刚中进士不久，而且自己还是张敬修等人的主考官，这自然是极为被动的，一向以老好人自居的申时行这次也罕见的不和稀泥了，他上疏自辩道：“考官止据文艺，安知姓名？”坚决否认在科举中有舞弊行为，朱载坖对此也是很重视的，科举舞弊，可是大事，尤其是还牵扯到阁臣，朱载坖命令陆绎率领锦衣亲军详查此事。
张四维、申时行等人也上疏抗辩，认为科举考官都是朱载坖亲自下旨任命的，而且有糊名、誊抄，等闲人等怎么能够作弊？而且李植、丁此吕等人，当年不向朝廷揭发此事，而是等到现在才向朝廷揭发，不是有意搞事情吗？而且阁臣之子，为什么不能够参与科举，朝廷并没有这样的规定。
对于此事，张四维、申时行等人是极为激愤的，他们上疏称，如果朝廷规定辅臣之子不能够参加科举，那么自己这些父亲，岂不是因为自己的前途而阻碍了儿子们的前途吗？如果是这样，他们宁可立即辞官不做，也不能因为自己而影响子孙的前途，而且朝廷之上，父子、兄弟接连中式，一向被称为美谈，怎么到了自己这里，就要受到这些人的质疑了？
阁臣们是相当激动的，其实朱载坖也很能理解阁臣们的想法，嘉靖以前，除了杨慎之外，阁臣子弟在任上中式确实是很少见的，主要是在于嘉靖朝廷两位当然首辅时间最长的严嵩和徐阶的儿子们，都没有走科举之路，严世蕃虽然号称小阁老，权重一时，但是确实走的恩荫的路子，原本徐阶是想培养自己的儿子徐蟠走科举之路的，但是徐蟠自己不争气，在南直乡试铩羽而归，还是被嘉靖荫官，所以在大明看起来形成了一个所谓的惯例，就是阁臣子弟一般不参与科举，以免为人所诟病。
所以张居正、张四维、申时行这三位阁臣遭到了整个朝廷的反对，因为他们认为阁臣子弟中式之后，前途肯定是比一般人更加广阔的，如陈以勤和陈于陛，陈以勤是朱载坖的老师，陈于陛中进士之后，就一直在翰林院工作，由于陈以勤的关系，受到历任首辅的重视，从李春芳到张居正、张四维等人，对于陈于陛都是极为看重的，现在陈于陛已经是担任礼部右侍郎兼翰林学士，国史总裁官，已经站到了离入阁只有一步之遥的位置上了，一旦国史修成，照例升迁修撰官员，陈于陛最少加礼部左侍郎，就具备了入阁的资格。
之前对于大明的这种翰林官员的师徒门生关系，已经有不少人提出了反对了，他们认为：“非翰林出身者不许推入内阁，使后相承入阁者，必其门生子弟，自相传受；后者未遇，感前人之接引；前者既老，责后人之报施；而凡身后赠、谥、荫子等事，不论忠邪，一皆预为已地，而尽力为之。”
本来朝廷实施南北榜，甚至在朝考的时候，也要控制庶吉士的籍贯，就是为了保证科举的相对公平，要提高北方、西北、西南等边远落后地区人才在进士和庶吉士群体中的占比，为其进入统治高层提供了制度保障，对改善高级和重要官员的地域结构、实现统治高层不同特点人才的优势互补具有重要意义；而且对增强朝廷凝聚力、促进社会稳定和巩固统一，发挥了不可替代的重要作用。
但是在实际政治生活中，科举的家族化已经越来越严重了。