不仅仅如此，佛郎机的各殖民地和其本土的关系也是十分之紧张的，殖民地的贸易与财富无限增长，与佛郎机本土的贸易也以人眼看得到的速度改善，却仍受宗主国的限制，引起殖民地土生白人的普遍不满，使殖民地和佛郎机本土政治关系更加紧张。
说白了，也就是佛郎机王室不会玩，建议他们从大明翻译一套资治通鉴去好好学学，这其实就是藩镇罢了，在大明是绝对不会允许这种事情发生的，当然虽然佛郎机有各种各样的问题，但是毕竟还是西洋强国，大明还是需要谨慎对待，朱载坖命令罗万化先和这些佛郎机使臣拖时间，然后采取各种措施，做好相应准备。
其中最重要的自然是有关货币的问题了，这点是对于大明影响最大的问题，也是佛郎机认为能够拿捏大明的问题，朱载坖召集太子、皇太孙和内阁以及相关部院的重臣们，商量相应的问题，朱载坖首先让太子就相关的问题加以阐述，太子对于有关货币的问题已经研究的很透彻了。
太子说道：“今天下之民愁居慑处， 不胜其束湿之惨；司计者日夜忧烦，惶惶以匮乏为虑者，岂布帛五谷不足之谓哉？ 谓银两不足耳，今我大明之银两，皆自海外而来，故可忧危者。向来钱铺所发之钱票，虽有便利，然其夺朝廷之利，故不得不以重法禁之。”
太子认为，白银不足对于大明的经济来说确实是极为严重的问题，所以之前这些银钱铺所发行的银钱票确实是一个可以解决这个问题的办法，原因很简单：“窃以人人皆有日用，既不便专使银两故以易换钱文，而钱文又不便携持，故不得不受彼纸票。”
金属货币最大的问题是不方便携带，不管是制钱还是银元，在大宗交易的时候都是极为不方便的，这点其实是大明君臣都知道的事情，在贸易中尤其是大宗贸易中这是极为不便利的，同时长途贸易携带大额的金属货币也是很不方便的。
现在大明的长途贸易市场的主要商品有粮食、棉花和棉布、丝和丝织品、铁器、 木材、茶叶、陶瓷、纸、糖、水果、杂货等。其中有些属于原始资源，有些则是手工业制成品，但不论是哪种都存在相应的产地和季节性周期。这点是极为重要的，这种季节性周期既受各地地形地貌、水文气候等因素的影响，也与农作物的品种和栽培技术、积肥周期、畜牧周期、劳动力状况等息息相关。
对于商人们而言，这就要求这些商人们在合适的季节奔赴相关的产地购买相应的货物，然后进行转运，而长途贸易往往是大宗商品交易，在各个环节都需要大量的资金支持， 自然也面临频繁的货币结算。这些商人携带大量的金属货币到处奔走，显然是极为不便的，所以各种票据和汇兑支付手段是很重要的，这点不光是太子很清楚，重臣们也都很清楚。
太子认为，在这些大宗贸易中，如果能够用票据取代货币的话，可以极大的缓解朝廷的钱荒，因为这样的话，商人的手中就不必随时囤积巨额的货币了，太子指出了一个很关键的问题，就是为什么大明的钱荒问题始终难以缓解，经济的发展固然是其中的一个原因，但是更深层次的问题还是豪商垄断资本的问题。
大明的这个豪商、工场主们所拥有的财富，是极为惊人的，尤其是这些商人，他们手中所握有的货币数量肯定是极为庞大，并非是因为朝廷所铸造的货币不足，而且市面上的货币不足，这完全是两个问题，当然造成这种问题的原因也是很多样的，首先就是在现在的情况下，朝廷严厉禁止各种钱票等物，导致商人必须以实物货币进行贸易，这样的话，商人们必然囤积足够的货币来应对贸易。
而除此之外，就是一些商人，囤积货币，有意制造钱荒，从而使得自己从中获利，这点也确实是存在的，所以太子认为朝廷的重点不是还要铸造多少货币，而是要让更多货币流通在市场上，才能够解决钱荒的问题，否则的话，朝廷无论铸造多少货币，市面上还是会缺少银钱了。
对于太子的这个看法，朱载坖认为是很正确的，太子在这个方面的表现甚至出乎了朱载坖的料想，这么多年的政务锻炼还是使得太子有了很大的长进，朱载坖当即说道：“朕看太子之言甚是，尔各部院要商量一个可行的办法，先上疏太子，由太子裁断之后再报朕知。”
朱载坖将此事交给了太子处理，自己则是要去处理和佛郎机等欧洲各国的关系了，朱载坖将利玛窦叫来，要求他回到欧洲，作为朱载坖的特使，前往教廷，向所谓的教宗说明大明的立场，佛郎机这是明白的在威胁大明，如果教会在这个问题上不给大明一个交代或者是继续和佛郎机沆瀣一气的，朱载坖作为大明皇帝是绝对不会坐视的，针对教会，朱载坖一样也要进行报复。
朱载坖很清楚，佛郎机是教会的忠实信徒，教会对于佛郎机王室是有很大的影响力的，朱载坖现在就是明着威胁教会，因为像尼德兰等大明在西洋的盟友，要么清教徒，要么是新教，他们和教会的关系是很恶劣的，但是朱载坖之前在宗教问题上一向是不表态的，从未在教会和新教之间选边站，但是这次朱载坖准备给教宗上点强度了，要是佛郎机仍旧坚持这个态度，大明就认为教宗在其中发挥了某种作用，大明不但要报复佛郎机，顺带也会报复教宗，同时支持尼德兰等地的新教，和罗马教廷对抗。
除此之外就是官员的调动，朱载坖任命李化龙为中南总督兼安南都护府大都护，负责统筹防备佛郎机的相关事宜，同时将南洋水师和缅甸水师前出到各藩属国的港口中，做好相应的准备。