纪元之种的光芒驱散了孢子树崩塌后的余烬，宇宙在新生的秩序与混沌交融中重归平静。不完美之种与纪元之种根系缠绕，在虚空中勾勒出金色的生命图腾，治愈着每一处被战火灼伤的星域。但在光芒无法触及的暗维度裂缝中，那双布满纹路的眼睛愈发明亮，伴随着低沉的呢喃，暗紫色的雾气开始在宇宙边缘弥漫。
裂缝文明的深空探测器突然传回异常数据，原本寂静的暗物质区域泛起诡异的波纹。“检测到未知频率的能量波动！”科学家的声音带着惊恐，“这些波动...正在干扰纪元之种的愈合频率，而且其模式...和守望者留下的平衡法则完全相悖！”更令人不安的是，不完美之种的藤蔓上开始出现黑色斑点，林婉的星光在花蕊中变得忽明忽暗：“有东西在暗中侵蚀共生本源...”
秦逸握紧刻满平衡印记的终焉之剑，剑身上的纹路与暗维度的波动产生共鸣，传来刺骨的寒意。他的意识被强行拽入一片漆黑的空间，无数模糊的低语在耳畔回荡：“平衡...不过是脆弱的谎言...”“差异...终将被彻底抹除...”黑暗中，隐约可见一个由代码与血肉交织的巨型轮廓，它的每一次呼吸都引发空间的震颤。
觉醒者们驾驶经过平衡法则强化的“星溯号”战舰，循着波动源头深入暗维度。但刚穿越维度裂缝，舰队就遭遇“概念扭曲者”的袭击。这些怪物由负面意识凝聚而成，有的化作实体化的“虚无”，能吞噬一切存在；有的变形为具象化的“混乱”，释放的能量能让思维陷入无尽的矛盾循环。残缺派修士发动“混沌清明诀”，以本心抵御意识侵蚀；裂缝文明则启动“逻辑重构炮”，试图击碎扭曲者的概念形态。
战斗中，小女孩的机械心脏突然解析出波动的核心频率。“是黑袍人残留的怨念！”她将药晶碎片与心脏融合，声音带着颤抖，“他的意识躲在暗维度深处，正在利用暗物质构建‘反平衡核心’！”众人加速前进，却发现暗维度的空间结构已被改写成巨大的迷宫，每一道墙壁都刻满了否定共生、鼓吹绝对秩序的箴言。
当舰队抵达核心区域，一座由暗紫色晶体堆砌的祭坛映入眼帘。祭坛中央，黑袍人的残魂悬浮在“反平衡核心”之上，他的身体半透明，面部扭曲成癫狂的狞笑：“守望者的平衡？不过是自欺欺人的美梦！只有绝对的秩序，才能终结文明的内耗！”他挥动手臂，祭坛释放出“熵增洪流”，所到之处，新生的星系开始加速衰老，生命形态退化为最原始的状态。
秦逸引导体内的平衡印记与不完美之种共鸣，在星溯号周围形成“共生屏障”。屏障与洪流碰撞，爆发出耀眼的光芒。他带领小队突破防线，却在接近核心时，被黑袍人召唤的“秩序绞杀者”阻拦。这些由纯粹秩序能量构成的怪物，手中的锁链能斩断因果联系。关键时刻，林婉燃烧最后的星光，化作星刃斩断锁链，她的虚影变得愈发淡薄：“快去摧毁核心...别让他...”
秦逸将所有力量注入终焉之剑，斩出“逆命平衡终章”。剑刃劈开反平衡核心的瞬间，黑袍人的残魂发出凄厉的惨叫，暗维度开始剧烈崩塌。但在核心毁灭前，一团暗紫色的怨念遁入宇宙深处，所过之处，新生的纪元之种嫩芽出现枯萎迹象。
战斗结束，秦逸望着重新陷入危机的宇宙，感受到体内平衡印记的躁动。不完美之种的藤蔓温柔地缠绕着他的手臂，林婉的星光在最后一刻化作光粒融入他的身体：“共生的路...我们一起走下去。”而在更遥远的暗维度裂缝中，那双神秘的眼睛闪烁着冷光，它轻轻触碰黑袍人残留的怨念，低声呢喃：“这场游戏，还需要更多...有趣的变数。” 宇宙的新危机，正在暗处悄然酝酿。