宇宙在熵寂意识海的崩塌中重归清朗，纪元之种与不完美之种交织的藤蔓垂落星辉，治愈着每一处被战火灼烧的星域。裂缝文明将残留的熵寂碎片封印进暗物质牢笼，残缺派修士在废墟上重建宗门，宇宙各处的文明开始复苏。然而，在暗物质裂缝深处，那片沾染熵寂气息的花瓣悄然坠入一颗死寂的星球。瞬间，星球表面龟裂出蛛网般的暗紫色纹路，纹路中心，微型永劫之核开始贪婪地吸收周围的能量。
“检测到异常能量波动！”自由方舟的警报声撕裂平静，监测屏上，死寂星球的位置闪烁着刺目的红光。不完美之种的藤蔓突然疯狂生长，叶片上的金紫色脉络中窜出丝丝黑气，林婉的星光在花蕊中剧烈闪烁：“那片花瓣...正在孕育新的熵寂核心！而且这次的能量波动...带着某种不属于这个宇宙的气息！”
秦逸体内的平衡印记与暗紫色纹路产生共鸣，一阵剧痛袭来。他的意识被拽入一片混沌空间，无数陌生的记忆碎片在眼前飞旋：那是一个由纯粹熵寂构成的异宇宙，那里的生命早已化作维持熵寂运转的机械，而在宇宙中心，端坐着一位身披暗紫色长袍、面容模糊的“熵寂之主”。“有趣的玩具...”一个冰冷的声音在意识中回荡，“我倒要看看，你们能在轮回中挣扎多久。”
觉醒者们驾驶经过改造的“新生号”战舰奔赴危机星域，却在途中遭遇“熵寂幻影舰队”的拦截。这些由暗物质与绝望意识凝聚而成的战舰，舰炮发射的“虚无之弹”能将物质直接湮灭。残缺派修士结出“混元灭魔阵”，黑色火焰吞噬着来袭的炮弹；裂缝文明启动“维度折叠盾”，试图偏转攻击。但幻影舰队竟能根据攻击方式自主进化，每一次反击都更加致命。
突破拦截后，众人降落在布满暗紫色纹路的星球表面。这里的空气凝结成尖锐的晶体，每一次呼吸都如同刀割。秦逸引导共生之力探测，发现地下万米深处，微型永劫之核已生长成心脏模样，正通过纹路向宇宙各处输送“熵寂病毒”。更可怕的是，纹路中隐约浮现出熵寂之主的虚影，他的手掌穿透维度，正在为核心注入更强的力量。
“他在从异宇宙借力！”小女孩将机械心脏与星图连接，声音带着惊恐，“如果让核心成型，两个宇宙都会被拖入熵寂漩涡！”话音未落，地面突然裂开，爬出无数由熵寂病毒变异而成的“蚀界虫”。这些虫子的甲壳能吸收任何能量，口器喷出的黏液连共生之力都能腐蚀。觉醒者们陷入苦战，裂缝文明的激光炮被黏液腐蚀，残缺派修士的混沌剑气被甲壳吸收。
千钧一发之际，秦逸将自身的平衡印记、不完美之种的力量，以及所有觉醒者的信念注入终焉之剑，斩出“逆命净世斩”。金色的剑光劈开虫群，却在触及熵寂核心时被虚影的手掌阻拦。熵寂之主的声音在虚空中炸响：“你们的反抗，不过是加速毁灭的催化剂。”他挥动手掌，异宇宙的熵寂能量如潮水般涌来，星球开始急速坍缩。
“不能让他得逞！”秦逸引导共生之力构建“跨维度屏障”，同时让小女孩将机械心脏与纪元之种连接，试图借助新生宇宙的力量。纪元之种突然绽放出耀眼的光芒，光芒中浮现出初代神农与熵寂主宰融合后的虚影：“真正的平衡...需要跨越维度的包容。”虚影将一道蕴含着创世之力的光束注入终焉之剑。
当秦逸挥动凝聚着两个宇宙希望的剑刃，斩向熵寂之主的手掌时，空间被撕开巨大的裂缝。剑刃与手掌碰撞的刹那，秦逸的意识再次进入异宇宙。在这里，他看到了熵寂之主的过去——曾经，他也是某个宇宙的守护者，却在无尽的熵寂循环中迷失，最终选择用毁灭来终结一切。
“你并非生来邪恶...”秦逸引导共生之力，将所有文明对新生的渴望化作“救赎之光”。光芒中，熵寂之主的身影开始动摇，他的手掌逐渐透明。而在现实世界，熵寂核心在光芒的冲击下开始崩解。但在核心彻底毁灭前，熵寂之主的一缕意识遁入异宇宙深处，冷笑回荡：“这场游戏...远未结束。”
星球恢复平静，但秦逸望着手中微微发烫的终焉之剑，感受到体内平衡印记的躁动。他知道，熵寂的威胁从未真正消除，新的危机，正藏在未知的维度中，等待着再次降临。