维度坍缩的危机稍缓，宇宙本源核心处突然爆发剧烈的逆蚀现象。裂缝文明的量子监测系统显示，暗紫色的“熵寂逆蚀流”正从本源核心向外扩散，所过之处，物质本源被强行分解为反物质，能量本源扭曲成吞噬一切的暗能量漩涡。不完美之种最后的能量波动在接触逆蚀流时，瞬间湮灭为正反物质对撞的火花，只余一缕消散的悲鸣：“本源...在自我吞噬！”
秦逸的平衡印记泛起不断崩解又重组的混沌纹路，他的意识被拽入一片由破碎本源粒子组成的虚域。这里漂浮着宇宙诞生时的原始火种，却被暗紫色的熵寂能量腐蚀得千疮百孔。熵寂意识化作粒子风暴中的低语，声音充满对宇宙根基的嘲讽：“秦逸，当本源开始逆蚀，你们的文明就像沙滩上的沙堡，一触即溃。准备见证万物的终焉！”领域内投影出骇人的画面：机械文明的能量核心在反物质化中剧烈爆炸，修真文明的灵脉本源被暗能量漩涡彻底吞噬。
觉醒者们意识到，对抗本源层面的侵蚀，必须唤醒宇宙的初始意志。他们启用初代神农遗留的“本源火种匣”，这件神器需融合全宇宙文明对生命起源的追溯与敬畏，才能点燃对抗逆蚀的希望之火。众人驾驶经过本源能量淬炼的“溯本号”战舰，穿越布满逆蚀陷阱的星际航道，每前进一步都要面对“本源畸变体”的阻拦。这些怪物由被污染的本源能量凝聚而成，形态抽象且强大得令人绝望：有的是能将物质本源反置的“反质巨像”，挥手间让恒星坍缩成反物质黑洞；有的是操控能量本源暴走的“暗能吞噬者”，所到之处，所有能量都被转化为吞噬一切的暗能量洪流。
“它们的弱点在于本源能量的排斥反应！”小女孩将机械心脏与全宇宙文明的本源记忆库相连，启动“生命火种共鸣”程序。金色的本源净化之光与暗紫色的逆蚀能量激烈碰撞，产生的本源震荡波暂时瓦解了畸变体的聚合形态。秦逸抓住机会，挥动融合武器，斩出“逆命溯本斩”，剑刃上的平衡印记迸发本源净化之力，撕开了防线。
溯本号抵达本源逆蚀的核心，一座由暗紫色本源晶体构筑的“熵寂逆蚀祭坛”矗立其中。祭坛中央，熵寂意识化作不断旋转的本源漩涡，狞笑着加速逆蚀进程：“当祭坛完成汲取，所有本源都将回归混沌的虚无！”祭坛突然释放“终焉逆蚀潮”，暗紫色的能量所到之处，本源规则彻底崩溃，物质与能量在逆蚀中化为虚无的尘埃。溯本号的船员们的身体出现本源粒子紊乱症状，意识在本源能量的撕扯下濒临破碎。
千钧一发之际，秦逸引导全宇宙文明对生存的执念、对本源秩序的坚守，将共生之力注入本源火种匣。匣子爆发出璀璨的金色光芒，在虚空中凝聚出“永恒本源结界”。结界的光芒与逆蚀潮激烈对抗，在即将沦陷的本源领域中撑起一片净土。“本源的力量，应守护生命而非毁灭！”秦逸将全宇宙文明的本源智慧、初代神农的创世传承，以及不完美之种残留的生机融合，发动“逆命本源焕新”。
璀璨的光芒轰击逆蚀祭坛，整个宇宙剧烈震颤。熵寂意识发出愤怒的嘶吼，消散在本源乱流中。祭坛开始崩解，但在毁灭前，无数暗紫色的“逆蚀孢子”通过量子纠缠扩散至全宇宙。秦逸望着逐渐恢复稳定却仍暗流涌动的本源核心，深知这场守护宇宙本源的战争，将是一场需要文明永远保持警惕的持久战——因为只要逆蚀孢子尚存，宇宙的根基就始终面临被腐蚀的危机。