因果熔种的阴霾还未散去，宇宙的本源核心处轰然裂开一道暗紫色的深渊，从中缓缓升起一座吞噬万物的“本源熔炉”。裂缝文明的量子监测仪显示，熔炉正以惊人的速度抽取着物质、能量、甚至是构成宇宙的基本粒子，将它们熔炼成纯粹的熵寂之力。不完美之种最后的存在痕迹在熔炉的威压下彻底湮灭，只留下一缕绝望的回响：“一切...都将化为虚无！”
秦逸的平衡印记泛起混沌又诡异的纹路，他的意识瞬间被拽入熔炉核心。这里是一片由破碎本源交织而成的炼狱，质子与反质子在烈焰中同归于尽，暗物质与暗能量被撕扯成能量残渣。熵寂意识化作熔炉中的滚滚浓烟，声音充满对宇宙根基的不屑：“秦逸，当本源熔炉完成锻造，整个宇宙都将成为熵寂的傀儡。准备迎接万物的终局吧！”领域内投影出惨烈画面：机械文明的巨型能量矩阵在熔炉中熔化成液态，修真文明的灵脉本源被抽离得一干二净。
觉醒者们意识到，对抗这种威胁宇宙根基的危机，必须唤醒沉睡的本源之力。他们启用初代神农遗留的“创世火种”，这簇蕴含着宇宙诞生之初纯粹能量的火焰，需要全宇宙文明将各自的本源力量注入其中，才能与熔炉抗衡。众人驾驶经过本源能量强化的“护源号”战舰，向着熔炉核心进发，却遭遇“本源畸变兽”的疯狂阻拦。这些怪物由扭曲的本源能量凝聚而成，形态恐怖且力量惊人：有的是能将物质瞬间分解成基本粒子的“分解魔像”，有的是操控能量暴走的“混沌之影”，所到之处，一切存在都被化为乌有。
“它们的弱点在于本源能量的不稳定性！”小女孩将机械心脏与全宇宙文明的本源共鸣网络相连，启动“本源净化核心”。金色的净化之光与暗紫色的熵寂能量激烈碰撞，产生的本源震荡波暂时削弱了畸变兽的力量。秦逸抓住机会，挥动融合武器，斩出“逆命护源斩”，剑刃上的平衡印记迸发本源之力，撕开了防线。
护源号抵达熔炉核心，一座由暗紫色本源晶体构筑的“熵寂本源核”悬浮其中。本源核表面布满跳动的裂痕，每一道都在加速宇宙本源的流逝。熵寂意识化作本源核中的咆哮：“当本源核达到临界值，所有的一切都将回归混沌！”本源核突然释放“终焉本源洪流”，暗紫色的能量所到之处，物质开始逆向演化，能量失去流动的方向，连空间和时间都出现了崩塌的迹象。护源号的船员们的身体开始出现本源粒子紊乱的症状，意识在本源洪流的冲击下摇摇欲坠。
千钧一发之际，秦逸引导全宇宙文明对生存的渴望、对本源的敬畏，将共生之力注入创世火种。火种爆发出耀眼的金色光芒，在虚空中凝聚出“永恒本源壁垒”。“宇宙的本源，不容亵渎！”秦逸将全宇宙文明的本源智慧、初代神农的创世传承，以及不完美之种残留的生机融合，发动“逆命本源重燃”。
璀璨的光芒与本源洪流激烈对抗，整个宇宙剧烈震颤。熵寂意识发出愤怒的嘶吼，消散在本源乱流中。本源核开始崩解，但在毁灭前，无数暗紫色的“本源熔种”通过量子纠缠扩散至全宇宙。秦逸望着逐渐恢复平静却仍危机四伏的宇宙，深知这场守护宇宙本源的战争，不过是文明与熵寂漫长对抗中的又一座险峰——而每一颗本源熔种，都可能在未来的某一刻，引发新的灾难。