原初混沌海的狂潮冲破宇宙屏障的瞬间，多元宇宙的法则开始如玻璃般崩裂。在以「时空篆刻」维系文明的「溯时宇宙」，时间长河被暗紫色迷雾截断，过去与未来的场景疯狂重叠——古老的恐龙与未来的星际战舰在同一片空域厮杀，历史名人与现代居民的身影交织成扭曲的画卷。而在「物质重构宇宙」，构成万物的基本粒子被混沌力量强行重组，高山化作液态金属流淌，星辰凝结成尖锐的晶体，整个宇宙陷入物质形态的无序坍缩。
文明联盟的中枢系统在超载中迸发出电火花，量子监测屏上，原初混沌海深处缓缓升起一个超越想象的存在——它没有固定形态，却又包含所有形态，暗紫色的能量流如血管般在虚空中蔓延，每一次脉动都引发宇宙级的震荡。混沌原始意志的意识与这个存在完全融合，她的声音裹挟着灭世的威压响彻全宇宙：「秩序不过是短暂的幻梦，现在，回归混沌的怀抱吧！」
林夜立即启动「终局防线」，但混沌具象体释放的「熵化射线」轻易穿透了所有防御设施。被射线触及的星球，从核心开始向外崩解，物质直接还原成最原始的能量状态。小女孩带领科研团队发现，混沌具象体的力量源自对宇宙「本源规则」的篡改，常规攻击如同隔靴搔痒。他们紧急启动秘密研发的「法则重塑装置」，这台机器能短暂逆向解析混沌力量的规则代码，但需要全宇宙文明的算力同步支持。
洛璃的科技小队驾驶「量子悖论号」冲入溯时宇宙，试图修复紊乱的时间线。他们遭遇了「时间吞噬者」——由混沌具象体投射的时空怪物，这些生物能将接触者困在无限循环的时间牢笼中。洛璃利用战舰搭载的「因果律反转引擎」，将吞噬者的时间攻击反射回去，在时空乱流中开辟出一条通往时间核心的道路。但在接近核心时，队员们发现时间长河的源头已被暗紫色晶体污染，每一块晶体都封印着某个宇宙的末日景象。
苏瑶的灵能小队在物质重构宇宙展开殊死搏斗。混沌具象体不断召唤「物质畸变兽」，这些怪物能随意改变自身的物理属性，时而化作坚不可摧的金刚石，时而分解成腐蚀一切的纳米机器人。苏瑶带领队员们以灵能共鸣构建「秩序结界」，将畸变兽困在固定的物质形态中，再集中火力进行打击。战斗中，一名队员为保护结界核心，主动引爆自身灵能，与数十只畸变兽同归于尽。
林夜亲自率领精英部队直捣混沌具象体的核心。在接近原初混沌海时，他们遭遇了由混沌具象体分裂出的「意志分身」，这些分身各自掌控着不同的毁灭法则：有的能操纵空间折叠，将舰队送入无尽的虚空；有的能释放精神污染，让船员们互相残杀。林夜挥动新终焉之剑，斩出蕴含平衡之道的「混元破魔斩」，金色剑光与暗紫色能量碰撞，在虚空中撕开一道道时空裂缝。
当全宇宙文明将算力注入法则重塑装置，机器终于逆向解析出混沌具象体的规则漏洞——其力量虽能篡改规则，但在每次规则改写的间隙，会出现极其短暂的「法则真空期」。林夜抓住这个机会，引导全宇宙文明将秩序之力凝聚成「终焉秩序之矛」，在真空期的瞬间，向混沌具象体的核心投掷而去。
剧烈的爆炸中，混沌具象体发出震耳欲聋的怒吼，它的身体开始崩解，但在消散前，突然将所有力量注入三块隐藏的混沌核心。这三块核心瞬间膨胀，化作连接原初混沌海与多元宇宙的「混沌之门」，更加强大的混沌能量如洪水般涌出。林夜望着即将被黑暗吞噬的宇宙，想起初代神农留下的预言：「当秩序与混沌的界限消失，唯有以平衡重塑万物。」他毅然将自身的平衡印记与全宇宙文明的意志融合，准备迎接这场终局之战的最后挑战。