魔法海洋在小魔仙们重新掌控力量平衡后，迎来了一段难得的宁静岁月。海萤堡的魔法平衡学院里，年轻的魔仙们在课堂上认真聆听着小魔仙们的故事，实验室中，陆野带领学生们研究着如何更安全地使用魔法能量。然而，这份平静却被一场突如其来的失踪事件打破。
在魔法海洋东部的彩虹珊瑚礁，生活着一对形影不离的好友——粉色海星桃子和人鱼少女娜希雅。桃子拥有治愈珊瑚的特殊能力，她轻轻触碰受伤的珊瑚，便能让其重新焕发生机；娜希雅则有着天籁般的嗓音，她的歌声能让狂暴的海洋生物平静下来。这天，她们像往常一样在珊瑚礁间嬉戏，却突然被一道神秘的紫色光芒笼罩，待光芒消散，两人踪迹全无。
最先发现异常的是她们的朋友小丑鱼泡泡。它惊慌失措地游到海萤堡，向小魔仙们求助：“桃子和娜希雅不见了！我亲眼看到那道紫光，感觉……感觉像是有什么邪恶的东西！”林小星立刻召集众人，她手腕上的星光护腕微微发烫，似乎在警示着危机的来临。苏糖吹响月光笛子，试图通过笛声寻找两人的踪迹，却只捕捉到断断续续、充满恐惧的声波回应。
陆野启动万象解析仪，对彩虹珊瑚礁进行扫描。仪器显示，那里残留着一种奇特的能量波动，既不是深渊之力，也不同于常规魔法，倒像是某种古老巫术与现代科技融合的产物。“这种能量……和我们之前遇到的黑袍科学家的改造技术有些相似，但又更加诡异。”陆野皱着眉头说道。星澜脸色凝重：“不管幕后黑手是谁，我们必须尽快找到桃子和娜希雅，否则后果不堪设想。”
小魔仙们迅速分成三组展开搜索。林小星、苏糖和小海负责探查魔法海洋与人类世界的交界处；陆野、小美和阿力前往曾经出现过神秘力量的区域寻找线索；小雨和海萤堡的魔法师们则留守，随时准备支援。
林小星一组在交界处发现了一艘破旧的人类渔船，船体上布满了奇怪的符文。正当他们靠近时，一群机械螃蟹突然从船舱中冲出。这些螃蟹的外壳闪烁着金属光泽，钳子上缠绕着紫色电流，显然是被改造过的战斗机器。林小星指挥星光化作光网困住螃蟹，苏糖用笛声干扰它们的行动系统，小海则召唤金飞鱼群发起攻击。战斗中，小海发现螃蟹身上的符文与困住桃子和娜希雅的紫光能量频率一致，这更加确定了他们的猜测——此事与黑袍科学家的残余势力有关。
另一边，陆野带领的小组在一座废弃的海底火山中发现了一个秘密实验室。实验室里摆放着各种诡异的仪器，培养舱中漂浮着半人半机械的海洋生物实验体。在角落的电脑中，他们找到了一份加密文件，破解后显示的内容让人心惊肉跳：“海星与美人鱼的特殊能力，是打开‘梦境深渊’的关键钥匙，计划即将启动……”
就在小魔仙们准备深入调查时，实验室突然响起刺耳的警报声。四周的墙壁打开，无数机械章鱼涌了出来，它们喷射出的墨汁不仅带有腐蚀性，还能让人产生幻觉。陆野迅速分析出章鱼的弱点在眼睛，小美用画笔创造出巨大的镜子，将章鱼的攻击反射回去；阿力则挥舞着强化后的拳头，击碎试图靠近的机械章鱼。
经过一番苦战，小魔仙们终于在实验室深处找到了关押桃子和娜希雅的牢笼。两人被浸泡在绿色的液体中，意识模糊。桃子的海星身体黯淡无光，娜希雅的鱼尾也失去了往日的光彩。就在他们准备解救两人时，黑袍科学家的身影再次出现。他的身体经过了更多机械改造，脸上戴着冰冷的面具：“魔仙们，你们又来坏我的好事！桃子和娜希雅的力量，将帮助我唤醒梦境深渊中的恐怖存在，到那时，整个魔法海洋都将成为我的囊中之物！”
黑袍科学家挥动手中的权杖，实验室开始崩塌，更多的机械怪物从四面八方涌来。小魔仙们一边战斗，一边保护桃子和娜希雅。林小星用星光开辟出一条道路，苏糖的笛声为众人保驾护航，陆野则操作仪器，试图关闭实验室的自毁程序。
在激烈的战斗中，小魔仙们发现黑袍科学家的力量来源是权杖顶端的紫色宝石。他们决定集中力量攻击宝石，林小星的星光长矛、苏糖的月光剑阵、陆野的能量炮……所有力量汇聚在一起，击中了紫色宝石。随着一声巨响，宝石破碎，黑袍科学家发出不甘的怒吼，他的机械身体在爆炸中四分五裂。
小魔仙们成功救出了桃子和娜希雅。在众人的守护魔法和桃子自身治愈能力的作用下，两人逐渐恢复意识。但他们从黑袍科学家留下的只言片语中得知，梦境深渊的威胁依然存在，一场更大的危机正在黑暗中酝酿。回到海萤堡后，小魔仙们开始着手研究如何应对即将到来的挑战，而桃子和娜希雅也决定加入他们，用自己的力量守护这片热爱的海洋。