最臭名昭着的代表是关东军防疫给水部，通称 731部队。它不仅仅是“细菌部队”，更是一个以活体人体实验为核心的生物武器研发、测试和生产的综合性军事机构。
成立时间与地点：1932年在中国哈尔滨设立秘密研究中心，最初由石井四郎大佐主导，后于1936年正式扩建为关东军防疫给水部。
总部位置：位于哈尔滨市平房区，建有庞大的专用设施，包括监狱、实验室、飞机场和焚尸炉。
主要负责人：石井四郎，京都帝国大学毕业的医学博士，是细菌战理论的狂热鼓吹者和实践者。
另外还有
516部队（关东军化学部）驻地：齐齐哈尔
罪行： 研发化学武器（芥子气、路易氏剂等）在中国战场多次使用毒气
100部队（关东军军马防疫厂） 驻地：长春孟家屯
罪行：针对牲畜和农作物的细菌战研究，实验波及人类（炭疽、鼻疽等）
1644部队（华中防疫给水部）驻地：南京（“荣”字1644部队）
罪行：与731部队合作进行人体实验，在华东地区散播鼠疫、霍乱
1855部队（华北防疫给水部） 驻地：北京（“甲”字1855部队）
罪行： 活体解剖、细菌武器试验，在华北地区实施细菌战
8604部队（华南防疫给水部） 驻地：广州（“波”字8604部队）
-罪行：使用难民和战俘进行实验 在广东、广西投放病原体
其他部队简表
| 部队编号 | 名称\/性质 | 驻地 | 主要罪行 |
|----------|----------------------------|--------------|------------------------------|
| 659部队 | 关东军化学武器分部 | 东北 | 化学武器生产与测试 |
| 643部队 | 海军细菌战研究部队 | 哈尔滨 | 与731部队协同实验 |
| 673部队 | 关东军防疫给水分部 | 牡丹江 | 细菌武器野外试验 |
| 162部队 | 化学武器部队 | 东北 | 毒气弹制造与使用 |
| 543部队 | 陆军化学战研究部队 | 沈阳 | 毒气人体实验 |
| 513部队 | 航空细菌战研究部队 | 东北 | 空投细菌武器研究 |
| 1875部队 | 南方军防疫给水部 | 新加坡 | 在东南亚实施细菌战 |
| 9240部队 | 陆军特种武器研究所 | 日本本土 | 后期整合细菌战数据 |
共同特点
1. 人体实验：均使用中国、朝鲜、苏联战俘及平民进行活体实验（日军称“马路大”）。
2. 战场应用：在浙江、湖南、云南等地实施细菌战，导致大规模瘟疫。
3. 战后掩盖：日本投降前销毁大部分证据，部队成员多数未受审判。
- 森村诚一《恶魔的饱食》（揭露731部队罪行）
- 中央档案馆《细菌战与毒气战》（中国官方档案汇编）
这些部队是日本军国主义反人类罪的铁证，其历史细节仍在各国学者研究中不断被揭露。