暗紫色的终末种子在未知星系生根发芽，其藤蔓如巨蟒般缠绕行星，结出的幽蓝果实内部，一个个文明世界正被秩序之力重塑。与此同时，秦逸体内的暗紫色代码与不完美之种内的秩序孢子产生共鸣，他的左眼泛起诡异的紫光，意识中不时闪过黑袍身影的冷笑。林婉的星光在花蕊中剧烈摇曳：“这些果实是新的秩序囚笼，每个都封印着能颠覆宇宙的力量...”
自由方舟的警报声撕裂寂静，裂缝文明的监测屏上，幽蓝果实的能量波动如同瘟疫般扩散。“检测到果实内部存在完整的时空结构！”科学家的声音带着绝望，“它们正在吸收周围星系的创生之力，一旦成熟...”话未说完，一颗果实突然裂开，释放出能将物质分解成秩序数据的“熵化雾霭”，附近的星球瞬间沦为闪烁着代码的废墟。
觉醒者们驾驶“混沌裂隙号”奔赴危机星域，却在途中遭遇“秩序摆渡人”的阻拦。这些摆渡人由暗物质与文明记忆碎片构成，身披的斗篷上印满初代神农的医典符文，手中的船桨一挥，便能扭曲时空。残缺派修士发动“万象混沌诀”，试图扰乱空间法则，裂缝文明则发射“记忆干扰弹”，却发现攻击被摆渡人吸收，转化为更强的防御。
“他们的力量源自被囚禁的文明记忆！”秦逸引导归墟残能在体内形成漩涡，强行吞噬船桨释放的秩序能量。战斗中，他的意识意外闯入一颗幽蓝果实——这里是一个被改造成精密医疗系统的世界，居民们的身体被改造成机械义体，思想被植入“绝对治愈”的程序，连呼吸都遵循着严格的数学公式。
“这就是完美秩序的模样。”黑袍身影突然现身，他的面容被阴影笼罩，声音却让秦逸浑身发冷，“没有病痛，没有死亡，没有...无用的情感。”黑袍人挥手召出“秩序审判庭”，十二尊由法典凝成的巨像挥舞着能斩断灵魂的法槌，将觉醒者们的攻击尽数反弹。
千钧一发之际，小女孩将机械心脏与苏瑶药晶融合升级，发射出“共情共振波”。波流所到之处，审判庭的法槌出现裂痕——被囚禁的文明记忆在共鸣中苏醒，开始反噬秩序力量。秦逸抓住机会，挥动终焉之剑斩向果实核心，却发现核心处悬浮着一颗跳动的“文明囚核”，囚核表面缠绕着无数发光的锁链，每一根都连接着一个被改造的生命。
“这些锁链...是用他们的反抗意志锻造的。”林婉的星光化作光刃，试图斩断锁链。但黑袍人发动“秩序终焉”，果实内部的时空开始坍缩，将觉醒者们困在不断缩小的囚笼中。裂缝文明的工程师启动飞船的“维度锚定装置”，暂时稳定空间，残缺派领袖则燃烧元婴，释放出能吞噬秩序的“混沌黑洞”。
秦逸在混乱中引导共生之力，将所有觉醒者的信念凝聚成“破序之矛”。当矛尖刺入文明囚核的瞬间，囚核爆发出耀眼的光芒，被囚禁的文明记忆如潮水般涌出。这些记忆中，不仅有痛苦与绝望，更有无数生命对自由的渴望。光芒中，黑袍人的身影开始动摇，他的斗篷下露出半张布满机械纹路的脸。
“你究竟是谁？”秦逸逼近黑袍人。对方却在消散前将一枚暗紫色的钥匙掷入果实深处：“当所有果实成熟...真正的秩序之主将降临。而你...不过是棋盘上的弃子。”随着黑袍人的消失，幽蓝果实开始崩解，但在宇宙的暗处，更多的果实正在吸收能量，而秦逸手中的暗紫色钥匙，正与他体内的代码产生共鸣，指引着下一场危机的方向...