宇宙核心重启装置的震颤平息后，表面暗纹虽已消散，但裂缝文明的引力波探测器捕捉到异常信号——核心深处传来一种类似心跳的脉动，其频率与所有文明的科技发展速度呈反比。不完美之种的藤蔓在各个星系中生长放缓，叶片上凝结出细密的霜状结晶，林婉的星光在花蕊中黯淡如烛：“有东西在抽离宇宙的生命力...就像在为下一次失衡蓄能。”
秦逸的平衡印记泛起诡异的灰芒，他的意识被强行拽入一片由破碎天平构成的空间。每个天平的两端，分别摆放着象征秩序的齿轮与代表混沌的火焰，而黑袍人残留的意识碎片化作无形的手，不断调整砝码的重量。“秦逸，你以为靠信念就能维持平衡？”冰冷的声音在空间回荡，“文明的发展本就是对天平的挑衅。”话音未落，无数画面在天平间闪现：某个机械文明因过度依赖AI，导致意识被数据同化；另一个修真文明在争夺灵脉的战争中，释放出足以毁灭星系的禁术。
觉醒者们组成“天平观测队”，驾驶搭载了时空锚定系统的“衡宇号”战舰，对各星系展开巡查。在半人马座旋臂，他们发现了惊人的异变：一颗本该处于文明萌芽期的星球，突然涌现出超越当前宇宙规则的科技造物，这些金属建筑表面布满与重启装置同源的纹路，正以惊人的速度吸收恒星能量。“这不是自然演化的结果！”裂缝文明的科学家放大监测画面，“这些纹路在改写星球的物理法则，就像...有人在强行加速文明进程。”
调查途中，衡宇号遭遇“失衡追猎者”的袭击。这些怪物由秩序与混沌的冲突能量融合而成，形态矛盾而扭曲：有的躯体由精密齿轮组成，却喷射着混沌火焰；有的表面流淌着液态的秩序纹路，内部却藏着无序的黑洞。残缺派修士结出“混元调和阵”，试图用混沌之力中和其能量，阵法却在接触怪物的瞬间被撕裂；裂缝文明发射的“规则解析弹”，也被转化为扭曲时空的漩涡，将战舰拖入危险区域。
千钧一发之际，小女孩将机械心脏与不完美之种的净化模块深度连接，启动“共生调和协议”。金色的调和波覆盖战场，部分追猎者的形态出现动摇，显露出其中被困的纯净能量。秦逸趁机挥动融合武器，斩出“逆命衡平斩”，剑刃上的平衡印记与秩序、混沌之力共鸣，暂时击退了敌人。但在清理战场时，他们从追猎者残骸中发现了暗紫色晶体，晶体内部封存着黑袍人残留的意识碎片，正不断重复着同一句话：“加速失衡...重启在即。”
循着晶体的能量波动，众人追踪至一片被称为“虚熵之海”的神秘区域。这里漂浮着无数由文明执念凝聚而成的岛屿，每座岛屿都在演绎着不同的失衡结局：有的岛上，秩序之力将所有生命改造成机械傀儡；有的则被混沌洪流吞噬，万物陷入永无止境的毁灭与重生。在海眼深处，一座由破碎天平搭建的祭坛缓缓浮现，祭坛中央，一个散发着幽蓝光芒的“失衡核心”正在运转，其表面的纹路与宇宙核心的脉动频率完全一致。
“欢迎来到失衡的摇篮。”黑袍人融合碎片后的意识体从核心中走出，他的身体不断在秩序与混沌形态间切换，“这个核心连接着所有文明的欲望与野心，只要有贪婪存在，天平就永远无法平衡。”祭坛突然释放“失衡潮汐”，所到之处，空间被撕裂成秩序与混沌的碎片，物质在两种极端力量的拉扯下分崩离析。
衡宇号在潮汐中剧烈摇晃，船员们的意识也开始出现分裂症状。千钧一发之际，秦逸引导全宇宙生命对和谐的渴望，将共生之力注入平衡印记，在虚空中凝聚出“永恒天平”。天平的两端，秩序与混沌的力量在共生光芒中逐渐调和。当“逆命共生衡定”的光芒斩向失衡核心时，整个虚熵之海开始震颤，但在核心毁灭前，一道暗紫色的光束射向宇宙各处，激活了隐藏在各个文明中的“失衡种子”。秦逸知道，这场关于平衡的较量，已经进入了最危险的阶段。